高頻變壓器結構設計時，應依據客戶提供的圖面或樣品，加上自己的設計經驗，盡量以3D進行模型設計，避免2D建圖和修改的缺陷，然后逐步進行修改，以至最終定案。如果是客戶設計不合理，應該主動提出與客戶技術人員共同重新確認骨架結構。骨架在設計時，需注意以下幾方面：
1.原材料需符合客戶的制程和要求，一定要按材質的特性進行骨架設計。一般參照黃卡進行骨架壁厚的確認；同時參照黃卡顯示的溫度，與客戶制程的烘烤及焊錫溫度作對比，是否滿足客戶之工藝條件。
2.金屬針腳，能順利通過或平帖客戶端的PCB板，一般使用鐵(鋼)質針腳較多。針對客戶有特殊要求針腳有更好的導電性的情況時，需考慮用銅質等導電性較好的材料。
3.目前RoHS、無鹵、SVHC等環保要求越來越急迫，選材的同時需滿足這些要求。
4.需符合高頻變壓器型號要求，外形尺寸需小于變壓器成品尺寸。
5.芯孔需配合磁芯中柱尺寸，一般比磁芯的上限公差要大；固定磁芯的葉片一般比磁芯的內徑下限公差要小。這樣設計的目的在于，為方便后續的磨損修模。 帖片類骨架為配合客戶的自動繞線作業中的松緊恰當要求(繞線過程中配合較松會使骨架脫落，緊了則操作員很難插入或拔出)，芯孔與繞線治具的配合公差則應控 制在0.05左右。
6.過線槽為銅線的拐線路徑，同時為避免生產中出現破損、插針裂腳、夾砂等異常情況，所以過線槽的寬度需終合考慮：銅線的直徑、針孔邊緣壁厚、毛邊處 理砂粒大小。一般情況下，過線槽適合做大，這樣可以避免夾砂，也方便客戶過銅線，但過線槽做大后，剩余的針孔邊緣壁厚便會偏小，插針生產時容易出現裂腳。
7.針孔不宜太深，針孔底部的壁厚需保證在0.5mm以上，避免插針時出現插裂或插穿孔的不良。
8.需做R角過渡，除增加強度防止破損外，還可改善生產時的一些問題。特別是過線槽邊緣，可防止把銅線外層的絕緣漆包膜刮傷；芯孔邊緣可方便磁芯插入；繞線管四周可增加葉片的強度等。
9.需設計插針防反向結構，以凸點效果最佳，這樣可以在跑道對應的方向增加凹槽與凸點對應，避免產品放反而導致的腳位錯。
10.擋墻較高或葉片較大的骨架，需設計脫模斜度，方便生產時脫模。
11.骨架有配套的蓋子時，應該注意與蓋子的配合部位的尺寸。
12.帖片式骨架繞線管中間的葉片，應該設計相應的掛鉤，防止繞線時銅線不到位的情況；葉片上還應該設計缺口，以便繞線針順利通過。
13.進料口處最好設計凹陷的缺口，視骨架大小而定，一般凹陷的缺口深0.5-1.0mm。這樣可以避免因撥料時的殘留原料影響產品的外形尺寸。如果無法設計缺口，在增加磨進料口的治具，以符合尺寸要求。
14.壁厚較厚的塑膠骨架，應在塑膠多的地方設計凹陷的缺口，盡量保證壁厚均勻，避免出現嚴重的縮水現象。